Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D13Ertd608eQ3UPR8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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