Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 CT009721.1-201ENSMUST00000213590 770 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rnf166Q3U9F6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms