Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Q3U6N9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Q3U6N9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms