Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kdm4dQ3U2K5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kdm4dQ3U2K5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms