Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms