Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Srsf6Q3TWW8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms