Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pnpla6Q3TRM4 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pnpla6Q3TRM4 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms