Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp39Q3TIX9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usp39Q3TIX9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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