Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc13Q3TIR1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms