Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TrioQ0KL02 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms