Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Pate4Q09098 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms