Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnn2Q08093 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms