Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
F13bQ07968 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms