Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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MestQ07646 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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MestQ07646 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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MestQ07646 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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MestQ07646 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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MestQ07646 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
MestQ07646 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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MestQ07646 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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MestQ07646 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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MestQ07646 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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MestQ07646 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
MestQ07646 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MestQ07646 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MestQ07646 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MestQ07646 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MestQ07646 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
MestQ07646 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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