Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Siah1bQ06985 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Siah1bQ06985 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms