Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Thbs2Q03350 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms