Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nhlh1Q02576 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms