Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atp9bP98195 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.4 ms