Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
H3f3aP84244 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms