Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Otx1P80205 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms