Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gfi1P70338 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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