Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Crnkl1P63154 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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