Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Vbp1P61759 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vbp1P61759 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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