Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Faf1P54731 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Faf1P54731 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Faf1P54731 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms