Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dbx1P52950 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dbx1P52950 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms