Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FmodP50608 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FmodP50608 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms