Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmod1P49813 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms