Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SrprbP47758 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SrprbP47758 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SrprbP47758 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms