Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cdkn1bP46414 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cdkn1bP46414 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms