Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VhlP40338 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VhlP40338 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
VhlP40338 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
VhlP40338 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
VhlP40338 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms