Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp4P35123 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp4P35123 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp4P35123 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp4P35123 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp4P35123 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp4P35123 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp4P35123 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp4P35123 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms