Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Apoc1P34928 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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