Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SsbP32067 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SsbP32067 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SsbP32067 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SsbP32067 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SsbP32067 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SsbP32067 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SsbP32067 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SsbP32067 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SsbP32067 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms