Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cd28P31041 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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