Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxd10P28359 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd10P28359 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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