Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gjb1P28230 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gjb1P28230 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gjb1P28230 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb1P28230 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb1P28230 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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