Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl3P27659 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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