Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PrkcaP20444 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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