Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RhoP15409 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RhoP15409 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RhoP15409 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms