Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd5P13379 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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