Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms