Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb4P10284 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb4P10284 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms