Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
BckdkO55028 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms