Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
DffaO54786 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
DffaO54786 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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DffaO54786 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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DffaO54786 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
DffaO54786 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
DffaO54786 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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