Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sp100O35892 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sp100O35892 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sp100O35892 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sp100O35892 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Sp100O35892 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Sp100O35892 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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