Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Opn1mwO35599 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Opn1mwO35599 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Opn1mwO35599 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1mwO35599 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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