Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Clk2O35491 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Clk2O35491 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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