Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kpna3O35344 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kpna3O35344 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kpna3O35344 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Kpna3O35344 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Kpna3O35344 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Kpna3O35344 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms