Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2O35245 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pkd2O35245 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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