Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hps1O08983 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms